分析：化石是保存在巖層中的古生物遺物和生活遺跡．直接說明了古生物的結構或生活習性．因此化石是研究生物進化最重要的、最直接的證據．化石在地層中出現的先后順序，說明了生物是由簡單到復雜、由低等到高等、由水生到陸生逐漸進化而來的，始祖鳥化石說明了鳥類是由古代的爬行動物進化來的等．故研究生物進化最直接、最主要的證據是化石．
解答：解：A、模擬實驗是在難以直接拿研究對象做實驗時，采取模擬實驗對象制作模型，或者模仿實驗的某些條件進行的實驗．關于生物進化難以再現，可采用模擬實驗法，例如米勒實驗．
B、比較是生物學研究中最常用、最重要的方法之一．此方法是根據一定的標準，把彼此有某種聯系的事物加以對照，確定它們的相同和不同之處．
C、生物進化的證據有化石證據、比較解剖學上的證據、胚胎學上的證據等，化石是研究生物進化最直接、最主要的證據．
D、生物進化的研究需要科學的推測，憑空想象是站不住腳的．
故選：C
點評：生物學研究的內容包括生物的形態(tài)、結構、生理、分類、遺傳和變異、進化、生態(tài)的科學
智慧課堂密卷100分單元過關檢測系列答案